《表1 PA7菌株次级代谢产物基因簇预测与分析》

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G199菌株16S rDNA序列上传至EZbiocloud数据库比对后显示,与铜绿假单胞菌PA7菌株的相似率为100%,该菌株来源于临床,基因组全长为6 588 339 bp。以PA7作为参考菌株,从NCBI下载其全基因组序列(序列号:CP000744.1),上传至antiSMASH Bacteria Version 4.0在线软件分析预测后,预测其次级代谢产物基因簇共有11个,隶属于7类基因簇:Nrps(非核糖体肽合成酶类)、Bacteriocin(细菌素类)、Phenazine(吩嗪类)、Siderophore(嗜铁素类)、Hserlactone(内脂类)、Arylpolyene(芳基多烯类)、Other(其它)。其中6个基因簇未知,与已知基因簇比较最高相似率为100%的有两个,分别是嗜铁素类和吩嗪类,得到预测基因簇信息(表1)。