《表2 Clean Data与参考基因组比对结果统计表》
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《外源脱落酸处理的干旱胁迫下山桃叶片的转录组差异表达分析》
三个试验组样本的数据碱基组成基本平衡,产出大量的高质量Reads,其大部分碱基质量打分能达到或超过Q30,说明测序所得的原始数据质量较好,可以满足后续的分析。9个样品的转录组测序,共获得67.14 Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到5.81 Gb,Q30碱基百分比在91.71%及以上。分别将各样品的Clean Reads与指定的参考基因组进行序列比对(ftp://ftp.bioinfo.wsu.edu/species/Prunus_persica/Prunus_persica-genome.v2.0.a1/assembly/Prunus_persica_v2.0.a1_scaffolds.fasta.gz、ftp://ftp.bioinfo.wsu.edu/species/Prunus_persica/Prunus_persicagenome.v2.0.a1/genes/Prunus_persica_v2.0.a1.gene.gff3.gz)。如表2所示,比对率从77.62%到93.09%不等,获取在参考基因组或基因上的位置信息,以及测序样品特有的序列特征信息。
图表编号 | XD00217989600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.20 |
作者 | 刘晓、陈修德、程宁、姜珊、张泽杰、王庆杰、高彦刚、肖伟、李玲、高东升、付喜玲 |
绘制单位 | 作物生物学国家重点实验室、山东果蔬优质高效生产协同创新中心、山东农业大学园艺科学与工程学院、作物生物学国家重点实验室、山东果蔬优质高效生产协同创新中心、山东农业大学园艺科学与工程学院、作物生物学国家重点实验室、山东果蔬优质高效生产协同创新中心、山东农业大学园艺科学与工程学院、作物生物学国家重点实验室、山东果蔬优质高效生产协同创新中心、山东农业大学园艺科学与工程学院、作物生物学国家重点实验室、山东果蔬优质高效生产协同创新中心、山东农业大学园艺科学与工程学院、作物生物学国家重点实验室、山东果蔬优质高效生产协同 |
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