《表1 测序数据信息统计：栽培种西番莲基因组序列及比较基因组分析》

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《栽培种西番莲基因组序列及比较基因组分析》

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由美国农业部Beltsville Agricultural Research Center的研究人员利用Illumina GAII技术对栽培种西番莲CGPA1进行测序，平均测序深度为4.5×，共获得225 293 527个Reads，随后，利用SOAP de novo对14.1 Gb有效数据进行组装，并采用K=25构建Contig和Scaffold，得到栽培种西番莲基因组序列165 656 733 bp（表1），获得235 883个Contig，Contig N50为1 303 bp，Contig L50为30 212 bp；获得了234 012个Scaffolds，Scaffold N50为1 311 bp，Scaffold L50为30 081 bp；GC含量为38.6%。