《表2 栽培种西番莲基因组注释》
将基因集与NR、SwissPort、KEGG、InterPro、Pfam和GO数据库进行BLAST,获得基因注释结果(表2)。在KEGG数据库中,栽培种西番莲基因组注释到16 835个基因,长度为61~6 994 bp,平均长度为670 bp,总长度为11 784 169 bp,占基因组序列的7.1%。栽培种西番莲的预测基因能比对到282个植物基因组上,其中3 015个基因序列比对到毛果杨(Populus trichocarpa)基因组上,2 058个基因序列能比对到麻风树(Jatropha curcas)上,1 644个基因序列能比对到蓖麻基因组上,630个基因序列能比对可可树(Theobroma cacao)(Argout et al.,2011)基因组上,572个基因序列能比对到葡萄(Vitis vinifera)(Jaillono et al.,2007)基因组上。
图表编号 | XD00156655100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.25 |
作者 | 吴艳艳、刘洁云、田青兰、黄永才、黄伟华、夏秀忠、杨行海、牟海飞 |
绘制单位 | 广西农业科学院生物技术研究所、广西农业科学院生物技术研究所、广西农业科学院生物技术研究所、广西农业科学院生物技术研究所、广西农业科学院生物技术研究所、广西农业科学院水稻研究所、广西农业科学院水稻研究所、广西农业科学院生物技术研究所 |
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