《表1 疫霉属各个种基因组组装及注释》

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《马铃薯致病疫霉研究进展》

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致病疫霉核基因组和线粒体基因组序列利用二代测序在2009年已经完成，首个测序菌株T30-4为A1交配型，核基因组大小约240 Mb，含18 288个Contig，75%以上为转座子区域和重复序列，（G+C）mol%含量约为52%，目前已经拼接到了Scaffold水平（GCA＿000142945.1）；第2个测序菌株为HP-10-31，交配型A2，拼接到了Contig水平（GCA＿001661535.1），两个菌株平均基因组大小为190 Mb，3/4以上为重复序列[104]。在目前已经报道的卵菌属中，P.infestans基因组比其他大部分种要大得多，Phytophthora sojae的基因组大小为95 Mb，Phytophthora xalni的基因组大小为65 Mb，基因组最大的为Phytophthora cambivora，大小236 Mb（表1）。值得注意的是，在基因组大小显著差异的情况下，有3个种注释的基因数相近，它们分别是14 451（P.ramorum）、16 988（P.sojae）和17 797（P.infestans）。在拼接过程中发现，P.infestans基因组中大量的转座子元件增大了基因组，而且具有“可塑性”[105]。因此，在和寄主互作过程中，效应子也在快速适应和变异。基因组的研究还发现，致病疫霉和疫霉属其他几个种都存在寄主跳跃现象（host jumps），而寄主选择压力也是、驱动疫霉属基因组进化的主要原因之一[106]。