《表1 引物及其序列:CRISPR/Cas9介导的荔枝霜疫霉基因组编辑系统的建立》

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《CRISPR/Cas9介导的荔枝霜疫霉基因组编辑系统的建立》


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对于pYF2.2-GFP-Ribo-sgRNA载体的重新构建,首先通过网站EuPaGDT(http:∥grna.ctegd.uga.edu/)设计出PlAvh133基因的sgRNA靶向序列共20 bp,随后利用网站RNA structure(http:∥rna.urmc.rochester.edu/RNAstructureWeb/Servers/Predict1/Predict1.html)检测其RNA的二级结构。选择合适的sgRNA靶向序列后,根据Fang等[12]的方法,将20 bp序列加上载体上的序列共两条反向互补的68 bp寡聚核苷酸送公司(上海生工)合成(表1),返回后将其稀释到100μmol/L,配成如下退火体系:3μL Sense oligo,3μL Anti-sense oligo,3μL 10×PCR buffer,4μL NaCl,19μL ddH2O。沸水浴2 min,室温放置冷却。最后将退火产物与经NheⅠ和BsaⅠ酶切的pYF2.2-GFP-Ribo-sgRNA进行连接转化。