《表1 引物序列:细胞周期因子Geminin对CRISPR/Cas9编辑效率的影响》
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《细胞周期因子Geminin对CRISPR/Cas9编辑效率的影响》
*下划线标注的是sg RNA序列,斜体标记的核苷酸序列是BbsⅠ酶切后的粘性末端连接位点。
将HEK293T细胞种在12孔板中,在细胞融合度达到60~70%时同时瞬时转染等量的wtCas9和Geminin-Cas9质粒(具体操作按Lipo3000转染试剂说明书),转染24 h后将培养基换成带有2.5μg/m L嘌呤霉素的培养基,筛选48 h后将细胞传代除去死去的细胞。在传代后的不同时间分别收集细胞样品,用细胞基因组提取试剂盒提取细胞基因组后,将提取的基因组作为模板,用测定引物COSMC-PCR-Forward和COSMC-PCR-Reverse(表1)通过基因组PCR得到包含靶序列的一段COSMC基因片段,用1%的琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物条带及其亮度后将PCR产物送到上海擎科测序公司进行测序鉴定。最后利用TIDE网站(https://tide.deskgen.com/)放入测序结果文件计算出Cas9对细胞中COSMC基因的编辑效率。每个样本包括3复孔,每个实验重复2次。具体实验过程示意图如图1所示。
图表编号 | XD00155004400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.20 |
作者 | 邹文涛、冯娟、吴方 |
绘制单位 | 系统生物医学教育部重点实验室上海交通大学系统生物医学研究院、系统生物医学教育部重点实验室上海交通大学系统生物医学研究院、系统生物医学教育部重点实验室上海交通大学系统生物医学研究院 |
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