《表2 目的基因的功能注释》

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《拟南芥CKI1基因上游转录调控因子筛选及鉴定》


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将上述获得的226个阳性克隆进行测序,然后将测序结果与拟南芥基因数据库中的基因进行比对,去除低质量及冗余重复的序列,共获得66条可读序列。对这66条可读序列进行基因功能注释,发现8个具有DNA结合功能的蛋白,包括RING/FYVE/PHD zinc finger家族蛋白、染色质组装修饰蛋白、组蛋白、AUX/IAA蛋白等(表2)。根据中央细胞转录组测序数据库[20],进一步分析了这8个候选基因在中央细胞中的表达情况,除了AT1G04550在中央细胞中不表达,其余7个基因在中央细胞中都有一定的表达量。因此,这7个基因可能是CKI1上游转录调控因子的候选基因。除了转录因子外,本研究还发现其中36个阳性克隆测序结果为一个功能未知基因—AT3G12965。该基因编码杂相RNA(miscellaneous RNA),是一类庞杂的小RNA分子,具有类酶催化、RNA加工和控制基因表达开关的作用[21]。目前对miscellaneous RNA研究极少,其具体的功能机制尚不清楚。