《表4 定位区间内基因的功能注释》

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《水稻包穗突变体sui2的遗传分析和基因精细定位》

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根据水稻基因组注释信息数据库（http://rice.plantbiology.msu.edu/cgi-bin/gbrowse/rice/），该区间内共包含14个基因和2个转座子（表4和图3-C）。对所有14个基因的基因组测序在野生型和突变体之间均没有发现差异，说明sui2的突变表型并不是由于DNA水平上的差异引起的。由于基因表达量的差异也会引起植株表型的变化，我们进一步分析了区间内14个基因在成熟期的表达水平。如图4所示，与野生型相比，在sui2中有4个基因明显上调，1个基因明显下调，而其他候选基因的表达量在两者之间无明显差异。鉴于该突变体为显性，我们重点关注表达量差异较大的2个基因LOC＿Os04g39420 （上调9倍）和LOC＿Os04g39430 （上调264倍）。经查阅文献，LOC＿Os04g39420编码了6-磷酸果糖激酶-2（6-phosphofructokinase-2），可能参与水稻籽粒淀粉的理化性质形成[17]；LOC＿Os04g39430编码了1个细胞色素450蛋白，为D11的1个等位基因，该基因的过表达植株的表型除了有包穗外，其他表型也与本实验的突变体sui2相似[18]。因此，我们认定LOC＿Os04g39430是参与调控水稻包穗表型的候选基因。