《表4 候选区域内非同义突变基因和移码突变基因功能注释》
为进一步对关联区域的基因进行挖掘,快速筛选获得与性状相关的基因,本试验利用BLAST软件对候选区间的编码基因进行KEGG和COG、GO等多个数据库的深度注释。KEGG数据库通过对基因间作用通路对基因的功能进行解读,注释结果显示(图6),富集到注释基因种类最多的依次为淀粉与蔗糖代谢、嘌呤代谢、核糖体、半乳糖代谢等。COG数据库能够对基因产物进行直系同源分类,注释结果显示(图7),富集较多注释基因的为防御机制、次生代谢产物的生物合成,转运和分解代谢、碳水化合物运输与代谢、翻译,核糖体结构与生物发生等。在候选区间中,多个数据库比对共注释到138个基因(表3)。在被注释到的基因中(表4),非同义突变基因10个,移码突变基因1个,这些突变的产生很可能与目标性状的表达差异有关。2.4.5候选基因的预测结合参考基因组和数据库的基因注释发现,Cla002367基因注释的信息为烯酰ACP-还原酶(ECR),该基因编码的酶在特长链脂肪酸(VLCFAs)生物合成过程中起重要催化作用;Cla011514、Cla002337和Cla002342基因注释结果为细胞色素P450(CYP),研究表明,部分P450家族基因的编码蛋白能够通过催化烷基的羟化、烃基的氧化等生物学反应影响脂肪族化合物的生成;Cla002353
图表编号 | XD0063596100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.01 |
作者 | 龚成胜、赵胜杰、路绪强、何楠、朱红菊、豆峻岭、袁平丽、李兵兵、刘文革 |
绘制单位 | 中国农业科学院郑州果树研究所、国家瓜果改良中心、中国农业科学院郑州果树研究所、国家瓜果改良中心、中国农业科学院郑州果树研究所、国家瓜果改良中心、中国农业科学院郑州果树研究所、国家瓜果改良中心、中国农业科学院郑州果树研究所、国家瓜果改良中心、中国农业科学院郑州果树研究所、国家瓜果改良中心、中国农业科学院郑州果树研究所、国家瓜果改良中心、中国农业科学院郑州果树研究所、国家瓜果改良中心、中国农业科学院郑州果树研究所、国家瓜果改良中心 |
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