《表4 qTBN7 1.71-Mb定位区间内14个候选基因功能注释》

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《玉米雄穗分枝数主效QTL qTBN7定位分析》

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注：基因的物理位置依据玉米B73参考基因组APGv3。

通过精细定位，将该雄穗分枝数主效QTL定位在7号染色体110 088 645～111 160 101 bp之间，利用玉米遗传学及基因组学数据库对该区间进行检索，发现共包含13个蛋白编码基因和1个miRNA（表4）。其中，GRMZM2G003927（ramosa1）编码C2H2锌指结构域转录因子，突变体遗传分析表明，其具有调控玉米雄穗分枝数功能[21]。DNA序列分析表明，该基因的CDS序列在两亲本间具有差异，CL103与掖478相比有3个碱基插入，此外还有3处单核苷酸的变异（图5）。其氨基酸序列在两亲本间也存在3处差异，分别是第39、87、139位氨基酸，可能影响蛋白质的三维结构，进而影响蛋白质的功能，其中，第39位氨基酸靠近该蛋白的锌指结构域，在该位点上掖478与CL103相比缺失了1个丝氨酸（图6）。两亲本该蛋白的三维结构预测结果显示，第87、139位氨基酸对蛋白三维结构可能没有影响，第39位氨基酸对蛋白的三维结构有一定影响，致使该蛋白在CL103中较掖478中蛋白链更长（图7）。