《表4 影响玉米地下节根相关性状的SNP及最可能的候选基因及其功能注释》

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《玉米花期根系结构的表型变异与全基因组关联分析》

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a每个SNP的物理位置是基于B73参考基因组v4版本得到；b区段内可能的生物学候选基因；c显著关联SNP落在已定位的QTL区间内

该群体的LD分析结果显示，r2衰减到0.2时群体的连锁不平衡衰减距离为250 kb（图7）。对关联分析得到的显著关联的SNP位点进行整理后，利用MaizeGDB网站在显著关联位点的LD范围内查找玉米地下节根相关性状的候选基因，并对候选基因进行统计。26个控制节根性状的基因组区段内共鉴定出177个候选基因，其中，具有功能注释的135个候选基因的功能富集分析表明，40个候选基因主要参与植物体内的代谢调节，13个候选基因与植物应激反应中涉及的生物途径相关，57个候选基因的功能未富集到结果，其余候选基因功能涉及运输活性、催化活性、结合蛋白及细胞成分等（图8）。根据每个显著关联SNP的LD范围内所有候选基因的功能注释，选择与目标性状相关的候选基因及其注释列于表4。