《表4 候选基因的基因注释》

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《粳稻分蘖数全基因组关联分析及候选基因的挖掘》

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本研究通过对qTiller9区间内全部15个基因进行单倍型分析，发现有6个基因不同单倍型的分蘖数存在极显著差异。进一步通过基因功能注释筛选候选基因，发现6个候选基因分别属于钙调蛋白依赖性蛋白激酶、肉桂酰辅酶A还原酶和蛋白结合蛋白。其中LOC＿Os09g2509和LOC＿Os09g25100均预测编码钙调蛋白依赖性蛋白激酶，其结构包括Ca M结合域、丝氨酸/苏氨酸激酶域和3个EF手基序，是多个Ca2+传感器中的一员，可以检测到Ca2+的瞬时浓度[30-31]，同时，Ca2+对脱落酸（ABA）的表达是必需的[37-39]。ZHU等[32]研究发现，9顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶Os NCED2是控制ABA合成代谢的关键酶，过表达Os NCED2的水稻转基因品系中，其分蘖数减少[33]；另外，拟南芥基因MAX3和MAX4均编码类胡萝卜素裂解双加氧酶，是ABA生物合成中的关键酶[34]，拟南芥突变体max4存在一种侧芽抑制信号，该信号由根部向上运输，并与生长素互作进而抑制植株侧芽发生，这种信号的前体是类胡萝卜素，而植物中ABA的前体同样为类胡萝卜素[35]；STEVEN等[36]进一步研究发现，拟南芥中的max3和max4突变体是由MAX3和MAX4损伤引起的，导致2种突变体侧向分支急剧增加。以上研究表明，ABA在植物侧芽发生中发挥重要作用。本研究在水稻表达数据库（Rice Expression Profile Database）中查询LOC＿Os09g25090和LOC＿Os09g25100在田间整个生长生育时期各组织的时空表达量，发现2个候选基因在水稻茎部均有较高强度的表达。因此，推测2个候选基因可能在水稻分蘖处表达，通过调节Ca2+浓度介导ABA合成代谢进而影响水稻分蘖数。