《表3 选择信号鉴定得到的候选基因功能注释》

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《基于温带和热带玉米群体全基因组F_(ST)和XP-EHH的选择信号检测》

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a受选择区域内较高FST值的基因；b受选择区域内较高XP-EHH值的基因；c基于maizeGDB的基因功能注释；d同时受到FST和XP-EHH选择的基因；*代表受到选择的关键基因（选择信号值高于top 1%）；**代表受到强烈选择的基因（选择信号值高于top 0.1%）aGenes with higher FST values in selec

利用FST鉴定得到557个候选基因和XP-EHH得到的1 913个候选基因。基因富集分析表明FST法得到的候选基因富集在生物学过程（biological process，P），共19个显著的GO条目（表2）。这些GO条目主要涉及到肌动蛋白发育调控、微丝的发育调控和细胞骨架构成等。利用XP-EHH得到的1 913个基因没有富集得到显著的GO条目，推测是因为热带玉米驯化温带玉米涉及到众多农艺性状的改变，并且许多农艺性状是由一系列微效数量位点控制，因此未能得到显著的GO条目。尽管如此，XP-EHH的方法仍然可以得到较多的选择基因，并且这些基因中鉴定得到了与玉米花期调控相关的基因，例如ZmCCT9和COL1。因此，通过选择信号的方法可以为解析玉米驯化的遗传机理、鉴定候选驯化基因提供实验依据。除了这些已经报道过的调控基因，还统计了选择信号值高于top 1%和top 0.1%的候选基因（表3）。另外，通过maizeGDB网站进行基因功能注释，发现这些基因均是玉米生长发育过程中的重要调控因子，例如GRMZM2G387528是一个光敏色素调节因子，参与玉米开花通路调控；GRMZM2G474769参与下胚轴的发育调控。