《表4 宁杂21号耐盐杂种优势基因的SNP位点及功能注释》

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《油菜杂交种宁杂21号及其双亲苗期在盐胁迫条件下差异表达基因分析》

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通过变异检测软件Samtools进行SNP Calling，然后采用F1中存在而父母本中均不存在SNP位点的原则，利用perl语言编程对宁杂21号中耐盐杂种优势特异基因，进行耐盐杂种优势相关SNP的筛选分析。结果发现，14个DEG具有高质量（基因型质量值大于90）的耐盐杂种优势相关SNP位点（表4）。对具有耐盐杂种优势相关SNP位点的基因分别进行了GO和KEGG功能注释，结果发现这些基因的功能大部分与逆境胁迫有关。