《表6 候选SNP位点注释情况》
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《利用QTL-seq技术定位甘蓝型春油菜早花位点cqDTFC8及其近等基因系构建》
转换与颠换的比率:2.03。
选择95%置信水平下大于阈值的窗口作为候选区间;候选区间内挑选两个子代在SNP-index差异显著的SNP位点,即挑选子代2(极端性状L)SNP-index接近0.85且子代1(极端性状E)SNP-index接近0.10的位点。对于候选的197个SNP位点,提取ANNOVAR的注释结果(表6),优先挑选使基因获得终止密码子的变异、使基因失去终止密码子的变异或者非同义突变或可变剪接的位点所在的基因作为候选基因。
图表编号 | XD00144020000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.20 |
作者 | 柳海东、赵绪涛、杜德志 |
绘制单位 | 青海大学农林科学院春油菜遗传改良重点实验室国家油菜改良中心青海分中心农业农村部春油菜科学观测实验站青海省春油菜研究开发中心、青海大学农林科学院春油菜遗传改良重点实验室国家油菜改良中心青海分中心农业农村部春油菜科学观测实验站青海省春油菜研究开发中心、青海大学农林科学院春油菜遗传改良重点实验室国家油菜改良中心青海分中心农业农村部春油菜科学观测实验站青海省春油菜研究开发中心 |
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