《表4 测序深度及覆盖度统计》
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《利用QTL-seq技术定位甘蓝型春油菜早花位点cqDTFC8及其近等基因系构建》
1×覆盖度:参考基因组中至少有1个碱基覆盖的位点占基因组的百分比;4×覆盖度:参考基因组中至少有4个碱基覆盖的位点占基因组的百分比。
将测序读长数据与参考基因组进行比对,参考基因组大小为850 292 103 bp,所有样本的比对率在98.14%~98.33%之间,说明样品测序数据和参考基因组相似性高,对参考基因组(排除N区)的平均覆盖深度在11.36~22.91×之间,1×覆盖度(至少有一个碱基的覆盖)在84.36%以上(表4)。覆盖深度和覆盖度能直接反映测序数据的均一性及与参考序列的同源性,本次测序数据较均一且与参考基因组序列同源性高。因此,比对结果正常,可用于后续的变异检测及相关分析。
图表编号 | XD00144019900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.20 |
作者 | 柳海东、赵绪涛、杜德志 |
绘制单位 | 青海大学农林科学院春油菜遗传改良重点实验室国家油菜改良中心青海分中心农业农村部春油菜科学观测实验站青海省春油菜研究开发中心、青海大学农林科学院春油菜遗传改良重点实验室国家油菜改良中心青海分中心农业农村部春油菜科学观测实验站青海省春油菜研究开发中心、青海大学农林科学院春油菜遗传改良重点实验室国家油菜改良中心青海分中心农业农村部春油菜科学观测实验站青海省春油菜研究开发中心 |
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