《表2 Cyan模块中核心基因的功能注释》

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《利用WGCNA进行棉花果枝节间伸长相关基因共表达模块鉴定》


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模块内基因的连通性(Connectivity)代表该基因与其他基因之间的调控关系,连通性越高,说明该基因在模块中的调控作用越大,越有可能成为潜在的枢纽基因。根据这个原理,首先对Cyan模块KEGG Pathway富集得到的植物激素信号转导通路中的121个基因以及GO Category富集分析得到的GO:0009725激素反应通路中的649个基因按照连通性进行降序排序,发现有13个编码茉莉酸ZIM结构域蛋白的JAZ(Jasmonate-zim-domain protein)基因的连通性显著高于所在通路中的其他基因。对于Cyan模块所有基因而言,该类JAZ基因的连通性排名也非常靠前,其中有8个JAZ基因的连通性在该模块内排名前10%,因此综合KEGG Pathway富集分析、GO Category富集分析和模块内基因连通性排序三个方面的数据结果,认定这13个JAZ基因作为本研究的枢纽基因(表2),即在棉花果枝节间伸长过程中发挥着重要调控作用的核心基因。