《表1 各模块的基本信息:基于蛋白质互作网络挖掘自闭症谱系障碍的功能模块与核心基因》
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《基于蛋白质互作网络挖掘自闭症谱系障碍的功能模块与核心基因》
通过MCODE算法对PPI网络进行分析,最终获得5个功能模块,包含68个核心基因(表1和图3)。节点颜色越深表明该节点在其模块网络中的连通度越高,即其所代表的编码基因在模块网络中的重要性越高。评分最高的模块1(M1)包含20个基因及146条边,平均每个节点含有7.3条边,说明该模块中的基因之间关系比较密切,其中排名靠前的基因有GRIN2B、GRIN2A、DLG4、MECP2、NLGN3、CNTNAP2、NLGN4X、FMR1、SHA-NK2等。模块2(M2)由20个基因和54条边组成,平均每个节点含有2.7条边,其中BDNF处于模块核心位置。模块3(M3)有16个核心基因,模块4(M4)含有的核心基因最少,仅4个。
图表编号 | XD00170762900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.30 |
作者 | 许逸聪、胡婉雪、谢芹、赵洪波、唐欣 |
绘制单位 | 昆明医科大学分子临床医学研究院暨云南省干细胞和再生医学重点实验室、昆明医科大学分子临床医学研究院暨云南省干细胞和再生医学重点实验室、昆明医科大学分子临床医学研究院暨云南省干细胞和再生医学重点实验室、昆明医科大学分子临床医学研究院暨云南省干细胞和再生医学重点实验室、昆明医科大学康复学院 |
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