《表1 基于拓扑学指标识别模块内核心基因》

《表1 基于拓扑学指标识别模块内核心基因》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于系统生物学方法的2型糖尿病遗传易感标志物的挖掘》


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注:“-”代表未检索到既往相关文献报道。

图2展示出模块内连通度排序最高的30个基因的蛋白-蛋白互作关系。通过检索NHGRI-EBI GWAS目录,我们发现其中的HNF4A、SYK、PPARG、FGFR3等基因已被先前的GWAS研究报道了与2型糖尿病的关联。表1列示出连通度最高的10个基因,分别为UBC、APP、GRB2、YWHAZ、ESR1、SUMO2、COPS5、SUMO1、CAND1和JUN。其中,GRB2、YWHAZ、ESR1、SUMO2、COPS5、SUMO1、CAND1和JUN与2型糖尿病存在名义关联,但尚未达到全基因组基因关联显著性水平(P=2.7×10-6,即0.05/18 479个基因)。既往的基础研究及以候选基因策略进行的关联研究已报道了APP、GRB2、YWHAZ、ESR1和SUMO2与2型糖尿病及其并发症的关联。