《表1 槲皮素蛋白相互作用的拓扑分析(6个核心基因)》

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《基于网络药理学和分子对接法探讨槲皮素治疗2型糖尿病的作用机制》


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在CTD、Gene Cards数据库共筛选出37525(29117+8 408)个基因,选取250个相关度得分较高的基因,然后将2个数据库得到的结果求并集并且删除重复项,得到424个与T2DM相关的靶点。对槲皮素靶点与T2DM相关发病机制靶点进行核查比对,得出槲皮素中与T2DM相关发病机制的121个作用靶点基因,包括MAPK1、JUN、RELA等。槲皮素作用靶点与T2DM相关发病机制靶点韦恩图见图1。槲皮素对T2DM作用靶点的PPI网络关系,通过Cytoscape软件中MCODE插件筛选出6个核心基因:NOS3、CYP1B1、NOS2、TGFB1、TTR和CDKN1A,见图2。槲皮素对T2DM作用靶点的蛋白互作网络的拓扑学分析,见表1。经Network Analyzer分析网络拓扑学属性发现,PPI网络(图2)包含104个节点,484条边,其中节点表示蛋白,每条边则表示蛋白与蛋白之间的相互作用关系,靶点越大表示关联度越强,其中平均节点度为9.31。