《表2 3味辛香类中药的靶点-ORs蛋白相互作用网络拓扑参数》

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《基于嗅觉受体的辛香类中药陈皮、丁香和小茴香药性表达的网络药理学研究》


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*两类节点间最短路径占所有路径的比值

通过Uniport数据库收集得到OR相关蛋白共515个,再将所获得的3味辛香类中药的所有潜在作用靶点基因和OR相关蛋白上传至在线STRING11.0数据库,置信度蛋白质参数评分值>0.9,然后运用Cytoscape 3.5.1软件构建3味辛香类中药的靶点-OR蛋白相互作用网络(图2)。如图3所示,筛去重复值后得到与OR相关蛋白存在相互作用的中药靶点共85个(陈皮25个、丁香63个、小茴香19个)。其中,陈皮和丁香共同作用靶点有5个,分别为MAPK8、F2R、TP53、AR、PPARG;丁香和小茴香共同作用靶点有7个,分别为HTR2A、CHRM4、CHRM3、PRKCA、ADRA2A、ADRB2、CHRM2;3味中药共同作用靶点有5个,分别为CASP3、PIK3CG、PRKACA、JUN、SCN5A。其中CASP3通过参与半胱氨酸蛋白酶的激活级联反应执行细胞凋亡过程[13]。PIK3CG是磷酸肌醇激酶-蛋白激酶B (phosphatidylinositol 3'-kinaseprotein kinase B,PI3K-Akt)信号通路的重要分子,受细胞外信号激活后,Akt可通过调节下游分子来影响细胞的生长及转化[14]。PRKACA属于环核苷酸依赖性蛋白激酶,是c AMP信号转导的主要效应器[15]。JUN是丝裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)信号通路的一个核靶点,MAPK是从细胞表面到细胞核的信号转导介质[16]。SCN5A可通过调控钠离子通道蛋白的表达调节电压依赖性钠离子渗透性[17]。这说明陈皮、丁香、小茴香均可通过作用于这5个靶点所在的c AMP、MAPK等信号通路来影响细胞的生长、转化及凋亡过程。拓扑分析结果(表2)表明每个基因的平均节点度为4.34,因此选取度值(degree)≥9的25个基因作为关键靶点(表3)。