《表2 中药-化合物-靶点网络关键节点及其拓扑学特征(前11名)》
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《基于网络药理学与分子对接技术的补肺活血胶囊用于新型冠状病毒肺炎(COVID-19)恢复期治疗的分子机制研究》
运用Cytoscape 3.7.0软件构建“中药-化合物-靶点”网络,见图1,共包括238个节点(3种中药节点,32种化合物节点,203种靶点节点)和544条边。并借助Cytoscape 3.7.0软件中的“Network analyze”功能对网络进行拓扑属性分析,其中度值与中心度值是衡量1个节点在网络中关键性的2个重要参数。选取度值与中心度值较大的节点,这些节点在网络中起到了枢纽作用,可能是关键成分或靶点[26]。该网络中平均每个活性成分与17个靶点相互作用,每个靶点平均与2.5个活性成分相互作用。以节点度值的平均数作为筛选标准,同时参考其中心度值,筛选出大于平均度值的化合物和靶点作为核心化合物和核心靶点,共得到11个核心化合物和52个核心靶点(表2),其中排名前5位的活性成分为槲皮素、山柰酚、7-O-甲基异丙醇胺、黄芩素、刺芒柄花素,分别能与137、53、33、30、29个靶点蛋白发生作用;排名前5的靶点为前列腺素G/H合酶2(PTGS2)、前列腺素G/H合酶1(PTGS1)、核受体共激活因子2(NCOA2)、丝氨酸蛋白酶1(PRSS1)、一氧化氮合成酶(NOS2),分别能与21、17、17、12、11个活性化合物相互作用。
图表编号 | XD00178401600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.12 |
作者 | 郭盛、武文星、谢红、李全、王恒斌、段金廒 |
绘制单位 | 南京中医药大学中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心、江苏省中药资源产业化过程协同创新中心、江苏省方剂高技术研究重点实验室、南京中医药大学中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心、江苏省中药资源产业化过程协同创新中心、江苏省方剂高技术研究重点实验室、南京中医药大学中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心、江苏省中药资源产业化过程协同创新中心、江苏省方剂高技术研究重点实验室、雷允上药业集团有限公司、雷允上药业集团有限公司、南京中医药大学中药资源产业化与方剂创新药物国家地 |
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