《表2 基因功能注释统计》

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《RNA-seq挖掘四倍体小麦紫籽主效基因》

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利用Blastx软件选取Nr、Nt、Swissprot、KEGG、KOG、Interpro、GO、Intersection等蛋白数据库对Unigenes进行蛋白质预测，分别预测了60715个、69132个、30 101个、36 627个、34 313个、27 996个、27 261个、12 123个蛋白（表2）。对预测蛋白进行同源比对后发现，四倍体小麦‘深紫1号’和‘高原3号’果皮转录本中26.54%预测蛋白与山羊草同源，24.81%预测蛋白与马铃薯同源，20.34%预测蛋白与普通小麦同源，剩余18.19%预测蛋白与其他物种同源。其中山羊草、大麦和小麦都属于同一麦类家族，而转录本中大部分蛋白与该家族具有高度同源性（图2）。