《表2 阴地蕨单一基因功能注释结果统计》
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《阴地蕨全转录组分析及植物激素信号转导相关基因筛选》
注:总体注释为被七大数据库中任意一个数据库注释上的Unigene总数。
将Unigene进行七大功能数据库注释(NR、NT、GO、COG、KEGG、Swissprot和Interpro),注释结果见表2。在NR(NCBI蛋白数据库,NCBI protein database)中得到最多注释(65.4%),总体注释率为69.25%。根据NR注释结果统计了注释物种分布(图2),在蕨类植物小立碗藓(Physcomitrella patens)和江南卷柏(Selaginella moellendorffii)中共注释了24%,跟阴地蕨蕨类植物属性相符,另外在常用的参比物种北美云杉(Picea sitchensis)中注释也较高(14.21%),可能跟北美云杉本身的注释较好有关(Ralph et al.,2008)。NR、COG、KEGG、Swissprot以及Interpro的注释结果展示在图3,在五个数据库中都注释上的有12522个,占全部Unigene的21.4%。
图表编号 | XD00156930400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.01 |
作者 | 张林甦、韩忠耀、王传明、邓先扩 |
绘制单位 | 黔南民族医学高等专科学校药学系、黔南民族医学高等专科学校药学系、黔南民族医学高等专科学校药学系、黔南民族医学高等专科学校药学系 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |