《表1 基因功能注释统计:1株来源于茅台酒酿造过程宛氏拟青霉MTDF-01的全基因组测序及分析》

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《1株来源于茅台酒酿造过程宛氏拟青霉MTDF-01的全基因组测序及分析》


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基于ab initio预测软件(Augustus、SNAP、GeneMark-ES)及同源比对预测两种方法对P.variotii MTDF-01测序拼接片段进行基因预测与编码区分析,共预测出基因8 815个,基因总长度为13 530 750 bp,平均基因长度为1 740 bp,平均编码序列长度为478 bp。预测基因序列采用多个数据库(KOG\\GO\\KEGG\\NR\\SwissProt\\TrEMBL)进行比对,获得相应功能注释信息,最终注释基因8 662个,详细统计数据见表1。在基因组序列上共找到5 044个简单重复序列,分别采用同源比对和de novo预测的方式对基因组的重复序列进行注释,结果显示该基因组中含有3.80%的重复序列。在基因序列上共找到tRNA数量为221个,rRNA为49个。