《表2 矮扁桃叶绿体全基因组注释基因信息》

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《孑遗濒危植物矮扁桃叶绿体全基因组特征分析及亲缘关系鉴定》

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注:（2）表示重复单元数为2

矮扁桃的叶绿体全基因组长度为158 596 bp；呈现出经典的四段式环状结构，其中大单拷贝区（LSC）长度为86 771 bp，小单拷贝区（SSC）长度为19 037 bp，两个反向重复序列（IRA/IRB）长度都为26 394 bp。矮扁桃的叶绿体全基因组中CG含量为36.8%，在LSC区域中CG含量分别为34.5%，SSC区域中CG含量分别为30.3%，IR区域中CG含量分别为42.7%和42.6%（见表1）。矮扁桃的叶绿体全基因组共注释130个基因，其中蛋白编码基因（Protein-coding genes，PCGs）为85个，转运RNA（t RNA）为37个，核糖体RNA（r RNA）为8个（见表2）。在130个注释基因中，有92个为单拷贝基因，包括69个PCGs、23个t RNA基因；剩余19种基因均重复1次，包括PCGs中的ndh B、rpl2、rpl23、rps12、rps7、ycf15、ycf2、ycf1和t RNA基因中的trn A-UGC、trn I-CAU、trn I-GAU、trn L-CAA、trn N-GUU、trn R-ACG、trn V-GAC以及4种r RNA基因。其中LSC区域完全包含59个PCGs和22个t RNA基因，SSC区域包含12个PCGs和1个t RNA基因，而IR区域则包含7种PCGs（rpl2、rpl23、ndh B、rps7、ycf1、ycf15、ycf2）和7种t RNA基因（trn A-UGC、trn I-CAU、trn I-GAU、trn L-CAA、trn N-GUU、trn R-ACG、trn V-GAC）以及全部4种r RNA基因（见图1）。