《表1 杜梨叶绿体基因组注释基因列表》

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《杜梨叶绿体基因组分析》


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注:a:IRs中有两个基因拷贝;b:包含一个内含子的基因;c:包含两个内含子的基因;d:假基因。

杜梨叶绿体基因组为典型的环状双链四分体结构,全长160 058 bp(图1)。其包括1个小的单拷贝片段(SSC,19 261 bp)、1个大的单拷贝片段(LSC,88 025 bp)和1对反向重复序列(IRa和IRb,26 386 bp)(图1)。杜梨叶绿体基因组一共注释到120个基因(表1),包括77个蛋白编码基因,33个tRNA基因、8个r RNA基因和2个假基因。这77个蛋白编码基因可分为3个大类。第一类包含28个与自我复制相关的基因,包括编码RNA聚合酶的3个亚基(大亚基、小亚基和DNA依赖性RNA聚合酶)。第二类包含40个与光合作用相关的基因(ATP合酶亚基、NADH–脱氢酶的亚基、细胞色素b/f复合物的亚基、光系统Ⅰ的亚基、光系统Ⅱ的亚基、二磷酸核酮糖氧合酶/羧化酶亚基)。第三类包括4个其他编码蛋白质的基因和5个功能未知的基因。