《表2 土壤样品基因组DNA测序数据统计及alpha多样性分析》

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《长江口崇明东滩湿地微生物群落结构研究》


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利用Illumina Mi Seq平台对细菌16S r RNA基因V4~V5区测序,测得的有效序列长度的中位数为413 bp。方差分析结果表明,两个湿地表层(DP10和DN10)之间的Chao 1指数、香浓指数和辛普森指数均未达到显著水平,而深层之间的Chao 1指数和香浓指数均表现为光滩湿地DN30显著高于芦苇湿地DP30(表2)。土壤样品覆盖度在0.89~0.92之间,OTU稀释性曲线均趋于平坦,表明测序深度包括了样品中的绝大多数细菌类型,测序数据量合理。有效OTU数表现为光滩湿地高于芦苇湿地,但未达到显著水平。