《表1 基因组统计及预测:风干肉中产脂肪酶瑞士乳杆菌TR13全基因组测序及序列分析》

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《风干肉中产脂肪酶瑞士乳杆菌TR13全基因组测序及序列分析》


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采用PacBio和Illumina HiSeq测序平台,对细菌TR13进行完成图测序,测序及预测结果如表1所示。TR13染色体基因组为环状分子,染色体总数为1,基因组序列总长度为2 172 224 bp,GeneMarkS软件预测没有发现质粒基因。平均GC含量为36.82%。对细菌的编码基因进行预测,获得编码基因(CDS数)2 356个,编码基因总长度为1 883 532 bp,平均长度为799.46 bp,基因密度(即基因组中每1 kb的碱基中所对应的基因数目)为1.08个/kb,占基因组百分比为86.71%,编码基因GC含量为37.47%,基因间区长度为288 692 bp,基因间区GC含量为32.57%,基因间区占基因百分比为13.29%。