《表1 已完成全基因组测序的部分植物乳杆菌》

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《植物乳杆菌生理特性及益生功能研究进展》


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注:表1是NCBI数据库中已完成测序的植物乳杆菌基因组的基本信息。

近年来,随着高通量测序技术的快速发展以及2003年第1株植物乳杆菌的全基因组测序的完成,掀起了全世界范围内植物乳杆菌全基因组测序的热潮。至2018年10月,完成全基因组测序并提交至美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的植物乳杆菌菌株有67株,基因组草图304株。已完成全基因组测序的部分植物乳杆菌概况见表1。对于植物乳杆菌全基因组序列的测定,以及结合功能基因组学研究,有助于我们全面、系统地了解植物乳杆菌基因组的结构和组成,进而从分子水平上为分析植物乳杆菌的生物学功能及应用提供依据。纵观植物乳杆菌全基因组的基本信息,发现植物乳杆菌具有以下特点:(1)全基因组的长度在2.9~3.7 Mb之间,是乳酸菌中基因组最大的种类;(2)G+C百分含量通常为45%左右,而双歧杆菌GC%含量高达60%左右,唾液乳杆菌GC%含量则低至33%左右。而植物乳杆菌与其他种类乳杆菌的重要差异在于已报道的植物乳杆菌基因组中,均有不编码细胞壁的蛋白酶存在[2]。