《表4 3株完整测序的植物乳杆菌菌株的同源性(COG)功能分类表》
注:B:染色质结构与动力学;C:能量生产与转换;D:细胞周期调控、细胞分裂、染色体分配;E:氨基酸转运与代谢;F:核苷酸转运和代谢;G:碳水化合物转运和代谢;H:辅酶转运和代谢;I:脂质转运和代谢;J:翻译、核糖体结构和生物合成;K:转录;L:DNA复制、重组和修复;M:
使用CDS对两株菌的基因组进行23个功能分类,分别获得了2 948、2 863个COG功能注释(表4)。在预测的CDSs中,可以发现两株菌参与碳水化合物运输与代谢、转录和一般功能预测最多。与植物乳杆菌MP37、WCFS1相比,植物乳杆菌M55参与碳水化合物转运和代谢(G)的基因数量最多,占总注释的11%;三菌株之间,MP37参与能量生产和转换(C)相关的基因最多,占总注释的4.3%之多。另外,MP37、MP55在防御机制(V)也进行了一定数量的注释(分别为88、79),且数量要多于对比菌株(60)。
图表编号 | XD00174027900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.20 |
作者 | 张欢畅、段云峰、徐黎明、蔡峰、律娜、朱宝利、常学东 |
绘制单位 | 河北科技师范学院食品科技学院、中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室中国科学院微生物研究所、云南农业大学资源与环境学院、中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室中国科学院微生物研究所、中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室中国科学院微生物研究所、中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室中国科学院微生物研究所、河北科技师范学院食品科技学院 |
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