《表3 C1菌株与GenBank中已知弗氏柠檬酸杆菌参考菌株的16S rRNA序列同源性比对分析结果》
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《中华绒螯蟹致病性弗氏柠檬酸杆菌的分离鉴定及其药敏特性》
采用API 20E细菌鉴定系统对C1菌株进行生理生化鉴定,结果(表2)表明,C1菌株为弗氏柠檬酸杆菌(C.freundii),其鉴定结果的可信度为99.3%;与弗氏柠檬酸杆菌参考菌株(杨移斌等,2013)的生理生化特性一致,且C1菌株16S rRNA序列(GenBank登录号MK069596)与GenBank中已有弗氏柠檬酸杆菌参考菌株16S rRNA序列的同源性达99%(表3)。由基于16S rRNA序列同源性构建的系统发育进化树(图3)也可看出,C1菌株与弗氏柠檬酸杆菌I-T-1-3株(GenBank登录号KU570303)的亲缘关系最近。因此,依据C1菌株的生理生化特性及16S rRNA序列分析结果,可确定C1菌株为弗氏柠檬酸杆菌。
图表编号 | XD0088637300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.01 |
作者 | 黄晓东、周慧华、安健、杨先乐、曹海鹏 |
绘制单位 | 国家水生动物病原库(上海海洋大学)、上海水产养殖工程技术研究中心(上海海洋大学)、水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心(上海海洋大学)、国家水生动物病原库(上海海洋大学)、上海水产养殖工程技术研究中心(上海海洋大学)、水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心(上海海洋大学)、连云港市海洋与渔业发展促进中心、国家水生动物病原库(上海海洋大学)、上海水产养殖工程技术研究中心(上海海洋大学)、水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心(上海海洋大学)、国家水生动物病原库(上海海洋大学)、上海水产养殖工程技术研究中心 |
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