《表3 菌株QPX1的16 S rRNA基因序列与GenBank中已知豚鼠气单胞菌菌株16 S r RNA基因序列同源性》
注:-,未记录。
菌株QPX1的生理生化鉴定结果表明(表2),菌株QPX1为豚鼠气单胞菌(Aeromonas caviae),与豚鼠气单胞菌对照菌株[6,8]生理生化特性有96.9%的一致性。此外,通过NCBI网站中的BLASTN软件将菌株QPX1的16S rRNA基因序列(GenBank收录号:MK652096)与GenBank中已知菌株的16S rRNA基因序列进行了同源性比较(表3),发现菌株QPX1的16 S rRNA基因序列与GenBank中豚鼠气单胞菌菌株的16 S rRNA序列自然聚类,同源性达到了99%~100%。通过邻接法构建的基于菌株QPX116S rRNA基因序列的系统发育分析(图1)进一步表明,菌株QPX1与豚鼠气单胞菌菌株J2(GenBank收录号:KP262414)的亲缘关系最近。结合生理生化鉴定以及16S rRNA基因序列分析的结果,判定QPX1为豚鼠气单胞菌。
图表编号 | XD00122449600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.01 |
作者 | 曾宪凯、曹海鹏、穆春华 |
绘制单位 | 上海市青浦区练塘镇农业综合服务中心上海鹏豪水产专业合作社、上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室上海市水产养殖工程技术研究中心上海高校知识服务平台上海海洋大学水产动物遗传育种中心(ZF1206)、上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室上海市水产养殖工程技术研究中心上海高校知识服务平台上海海洋大学水产动物遗传育种中心(ZF1206) |
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