《表2 已测序基因组中编码植物类R蛋白结构域的基因数》
注:“—”表示不清楚。
基于转录组分析(表2),龙眼基因组中含有大量差异表达的植物病原体抗性基因,包括编码NBS和NBS-LRR蛋白的基因,其数量分别为122和258个,数量高于番木瓜(26/20)、铁皮石斛(83/47)、香蕉(117/89)。番木瓜中NBS型R基因数量最少[5]。香蕉基因组序列中,防御相关基因NBS基因含有117个,NBS-LRR为89个,CC-NBS-LRR为27个。对香蕉的比较基因组研究中[10],在A、B、阿宽蕉基因组中分别鉴定出117、93、62个编码NBS-基因,研究结果显示编码NBS基因数量随着各种质栖息地从潮湿热带到凉爽亚热带的过渡而减少,即与纬度上升密切相关。另一方面,单子叶植物中多不含有TIR-NBS-LRR型R基因,研究比较发现这种现象在香蕉基因组中同样存在。罗布斯塔咖啡中NBS基因存在大量基因复制,该基因家族中,42个NBS基因分布于8号染色体上,且36个NBS基因存在于基因簇中,研究推测可能是由于连锁基因家族的重复和分化进化而来[25]。
图表编号 | XD00105091900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.25 |
作者 | 李丹、陈晓慧、赖钟雄 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |