《表2 Ib WRKY61互作蛋白编码基因测序结果(前10个)》
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《甘薯WRKY转录因子IbWRKY61互作蛋白的筛选及鉴定》
将上述菌落PCR扩增产物进行回收、纯化,条带大小完全相同的即视为重复,选其中之一作为代表进行后续实验。扩增条带大小有差异的均进行后续实验,共选出121个克隆的PCR扩增产物。为获得尽量多的候选互作蛋白,将PCR扩增产物混池后进行高通量测序。测序后获得的reads比对到基因,获得的基因序列中,TPM值最大可达93 616.73。拼接序列的前10条拼接长度、比对到基因上的reads数和TPM值列于表2。对基因序列进行比对后发现,TPM值前100的基因编码的互作蛋白中有大量与生物胁迫、病原菌防御以及水杨酸、茉莉酸响应相关蛋白,表明Ib WRKY61可能通过与其他蛋白互作而参与甘薯生物胁迫响应。
图表编号 | XD00192955100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.01 |
作者 | 张凯、刘莹莹、彭德良、吴正丹、毛丽敏、唐道彬、王季春 |
绘制单位 | 西南大学农学与生物科技学院、薯类生物学与遗传育种重庆市重点实验室、西南大学农学与生物科技学院、中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所、西南大学农学与生物科技学院、西南大学农学与生物科技学院、薯类生物学与遗传育种重庆市重点实验室、西南大学农学与生物科技学院、薯类生物学与遗传育种重庆市重点实验室、西南大学农学与生物科技学院、薯类生物学与遗传育种重庆市重点实验室、西南大学农学与生物科技学院、薯类生物学与遗传育种重庆市重点实验室 |
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