《表2 叶绿体基因组中含内含子蛋白编码基因的编码区长度和基因全长》

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《木犀科植物叶绿体基因组结构特征和系统发育关系》

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物种编号1–19同表1。表中/前数字表示编码基因长度（bp），/后数字表示基因全长（bp）。

在下载的19个叶绿体基因组中，31个蛋白编码基因（包括5个含内含子基因和26个无内含子基因）长度有变异。其中含有内含子的基因有petD、rps12、clpP、rpoC1和rps16，这5个基因中大部分基因编码区长度比较保守，基因长度差异主要取决于内含子的长度差异，甚至部分内含子丢失（表2）。clpP基因除在物种F.suspensa中编码区长度存在差异外（588 bp），在Jasminum属3个物种中均存在编码区长度改变和内含子丢失现象；rpoC1和rps16基因中未发现内含子片段缺失。与大部分物种相似，rps12基因存在反式剪切现象，即该基因的5'端在LSC区，3'端在IR区。无内含子的基因长度有差异（附表1）。不同基因差异程度不同，如atpA和psbH只在1个物种中长度有差异，rps15、ndhD、ccsA、rps19、rps3、infA和rps11也只在少量物种中存在差异，其余基因在不同物种中差异较大。