《表5 候选内参基因稳定性分析》
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通过geNorm、Normfider和Bestkeeper软件对7个候选内参基因的稳定性进行分析。geNorm软件是根据计算所得的平均表达稳定(average expression stability,M)值来表示候选基因的表达稳定性,M值越小候选基因稳定性越好[8]。geNorm分析结果表明7个候选内参基因的M值均较低(<0.4),其中ACT的M值最低,为0.249,稳定性最好,也最适合作为内参基因;18S的M值最大,为0.370。NomFinder是根据候选基因的表达稳定值(stability value,SV)来表示候选基因的表达稳定性,SV值越小,候选基因越稳定[8]。NormFinder分析结果表明ACT的SV值最小,稳定性最好;18S的SV值最大,geNorm与Normfider分析结果完全一致。BestKeeper软件是通过导入Ct值来计算获得候选内参基因在所有样品中的SD值。BestKeeper分析结果表明18S的SD值最小为0.130,稳定性最好;GAPDH SD值最大为0.252,稳定性最低。BestKeeper分析结果与geNorm和Normfider的分析结果差异较大。利用Excel对geNorm、Normfider和Bestkeeper 3个软件分析出的7个候选内参基因的稳定性排名几何平均数进行综合性评价,结果表明,ACT稳定性最好,最适合做为本研究的内参基因,β-TUB稳定性最低(表5)。根据3种软件排名稳定性的r值分析其相关性,结果发现geNorm与NormFinder的相关性最高(r=0.97),达到极显著水平,而NormFinder与Bestkeeper、geNorm与BestKeeper则均为负相关。
图表编号 | XD0065584200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.10 |
作者 | 马璐琳、崔光芬、王祥宁、贾文杰、段青、杜文文、王继华、陈发棣 |
绘制单位 | 云南省农业科学院花卉研究所、云南省花卉育种重点实验室、国家观赏园艺工程技术研究中心、南京农业大学园艺学院、云南省农业科学院花卉研究所、云南省花卉育种重点实验室、国家观赏园艺工程技术研究中心、云南省农业科学院花卉研究所、云南省花卉育种重点实验室、国家观赏园艺工程技术研究中心、云南省农业科学院花卉研究所、云南省花卉育种重点实验室、国家观赏园艺工程技术研究中心、云南省农业科学院花卉研究所、云南省花卉育种重点实验室、国家观赏园艺工程技术研究中心、云南省农业科学院花卉研究所、云南省花卉育种重点实验室、国家观赏园艺工 |
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