《表3 Best Keeper软件分析候选内参基因稳定性》
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《铜胁迫下紫鸭跖草根组织实时定量PCR内参基因的选择》
Best Keeper软件以每个样品的平均Ct值进行分析,稳定的内参基因在Best Keeper中应具有较低的标准偏差(standard deviation,s)、假定值(P)和变异系数(coefficient of variation,CV),以及高的相关系数(Pearson’s correlation coefficient,r2)(Pfaffl等2004)。Best Keeper的分析结果如表3所示,18Sr RNA(0.965)、TUB (0.953)和UBI (0.949)这三个候选基因的相关系数r2最大且假定值P均小于0.01,被Best Keeper判定为最稳定的候选内参基因;而候选内参基因Actin (0.587)的相关系数最小,并且其假定值P为0.096,故被Best Keeper判定为最不稳定的候选基因。这与Ge Norm和Norm Finder判定结果大致相同。综合3个软件对候选内参基因稳定性的排序结果,最终得到在不同铜浓度胁迫下紫鸭跖草根组织中最佳内参基因组合为TUB、18Sr RNA和UBI。
图表编号 | XD00218614600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.20 |
作者 | 杨坤、黄超、卢山、彭国颖、黄长干 |
绘制单位 | 江西农业大学理学院、江西农业大学校友办、江西农业大学理学院、江西农业大学理学院、江西农业大学理学院、南昌市植物资源化学利用重点实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |