《表3 Best Keeper分析内参基因的表达稳定性及排名》

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《屏边空竹实时荧光定量PCR内参基因的筛选》


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Best Keeper通过计算候选内参基因Ct值之间的配对相关系数(r)、标准偏差(s)和变异系数(CV)来衡量基因表达的稳定性,判定标准为s值、CV值越小,r值越大,基因表达越稳定。若某基因的s值大于1则认为该基因表达不稳定,不适合作为实验内参基因。在本实验中,6个候选内参基因在不同组织和笋芽发育成笋不同时期的表达稳定性差异较大:在不同组织中,PP2A和TIP41分别为表达最稳定和最不稳定的基因;在笋芽发育成笋的过程中,二者则表现出相反的表达模式。由候选基因在各样本中的s值可知,RPL3、GAPDH和TIP41基因在根、秆、叶中的表达不稳定,PP2A在笋芽和竹笋中的表达不稳定(表3)。