《表2 Ge Norm,Norm Finder和Best Keeper分析结果和排名》
Best Keeper软件作为内参基因稳定性分析常用软件之一,其分析结果中标准偏差(SD)和变异系数(CV)越小,则表明内参基因越稳定。Best Keeper分析结果可知(表2),6个内参基因基于SD值的稳定性排名为GAPDH>UBQ>ACT>18S r RNA>TUB>EF1α,基于CV值的稳定性排名为UBQ>GAPDH>ACT>18S-r RNA>TUB>EF1α。综合SD值和CV值结果,GAPDH和UBQ的SD、CV值均较小,表明其表达稳定性高,适合作内参基因,这与ge Norm软件分析的结果一致。EF1α的SD和CV值均最大,说明其表达稳定性最差,不适合作为西红花内参基因。Best Keeper与ge Norm和Norm Finder分析结果相似的是,18S-r RNA、EF1α和TUB相对稳定性差,前2个软件的分析结果为18S r RNA>EF1α>TUB,而Best Keeper的结果为18S r RNA>TUB>EF1α。因此,综合3个内参基因稳定性排名结果(表2),西红花6个内参基因的排名为GAPDH>UBQ>ACT>18S r RNA>EF1α=TUB。
图表编号 | XD00189142000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.28 |
作者 | 周琳、蔡友铭、杨柳燕、赵冰雪、李芳、张永春 |
绘制单位 | 上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室、上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室、上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室、上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室、上海应用技术大学生态技术与工程学院、上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室、安顺学院农学院、上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室 |
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