《表2 利用Norm Finder软件计算不同条件下候选内参基因的表达稳定值》
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《菰黑粉菌实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择及应用》
NormFinder以每个候选基因2-ΔCt值作为输入数据,通过候选基因两两配对方式算出稳定性数值;不同小写字母表示统计学差异显著(P<0.05);下同
使用3种软件ge Norm、Norm Finder、Best Keep‐er对菰黑粉菌融合过程各阶段的内参基因表达稳定性进行分析。ge Norm结果显示(图1C),8个基因的M值均小于0.5,表明8个基因在此阶段中表达均较稳定,具体排序为EIF-2α/60S r RNA (M=0.153)>β-Actin (M=0.186)>α-tubulin (M=0.218)>Ubiquitin (M=0.288)>GAPDH (M=0.327)>EF-1α(M=0.355)>28S r RNA (M=0.447)。Norm Finder软件选择β-actin (稳定值=0.101)为最稳定基因(表2)。而Best Keeper中,SD值小于1的有5个基因(表3),分别为GAPDH (SD=0.743)、EF-1α(SD=0.806)、Ubiquitin (SD=0.859)、α-tubulin (SD=0.963)和β-actin (SD=0.998)。因此,GAPDH、EF-1α、Ubiquitin、α-tubulin和β-actin是菰黑粉菌体外二型态转化阶段基因表达分析的合适内参基因,其中β-actin最佳。
图表编号 | XD00206396300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.25 |
作者 | 葛鑫涛、殷淯梅、高丽丹、胡映莉、夏文强、叶子弘、汤近天、张雅芬 |
绘制单位 | 中国计量大学生命科学学院、中国计量大学生命科学学院、中国计量大学生命科学学院、中国计量大学生命科学学院、中国计量大学生命科学学院、中国计量大学生命科学学院、中国计量大学生命科学学院、中国计量大学生命科学学院 |
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