《表4 BestKeeper分析不同条件下候选内参基因的表达稳定性》
BestKeeper软件根据内参基因在不同试验材料中所得的Ct值之间的标准偏差(SD)、变异系数(CV)以及相关系数(r)来综合评价内参基因的表达稳定性。其中SD值的默认阈值为1.0,低于该值即认为表达稳定;SD值和CV值越小,r值越大,内参基因越稳定。在花芽分化的不同阶段中,7个基因的SD值均小于1.0(表4),说明各基因的表达均较为稳定;在有花组不同器官中,7个内参基因的SD值均大于1.0,无花组中各基因SD值均在1.0以下,说明是否有花显著影响候选内参基因在不同器官中的稳定性。根据r值的大小对内参基因的稳定程度由高到低进行排序,不同阶段表现为UBQ>eIF-4α>EF-1α>Actin>18S r RNA>GAPDH>TUB;无花组不同器官中的排序为:eIF-4α>TUB>Actin>EF-1α>GAPDH>18S rRNA>UBQ。表明在花芽分化不同阶段,UBQ和eIF-4α表达最稳定,GAPDH和TUB表达稳定性最差;在无花组不同器官中,e IF-4α和TUB稳定性最好,Actin、EF-1α和GAPDH其次,18S rRNA和UBQ稳定性最差。
图表编号 | XD00152878200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.14 |
作者 | 王旭、敖妍、刘阳、张宁、郑雅琪、刘金凤、张行杰、张永明 |
绘制单位 | 北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室、国家能源非粮生物质原料研发中心、北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室、国家能源非粮生物质原料研发中心、北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室、国家能源非粮生物质原料研发中心、北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室、国家能源非粮生物质原料研发中心、北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室、国家能源非粮生物质原料研发中心、胜利油田胜大生态林场、胜利油田胜大生态林场、赤峰市翁牛特旗林业局 |
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