《表4 BestKeeper软件分析计算候选内参基因的稳定性》

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《银杏实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择与验证》

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*表示标准偏差大于1被排除的基因。

BestKeeper是Michael等（2005）人编写另外一种筛选内参基因的软件，该软件通过计算两两基因的标准偏差（SD）和相关系数（r），再通过比较各个值的大小，选择稳定性较好的内参基因。当SD>1时，表明该内参基因表达不稳定，可以排除其次对剩余内参基因的相关系数排序，相关系数越大则内参基因的稳定性越强。根据以上两个条件，筛选出合适的内参基因。由表4可知，所有样品、不同发育时期雄株叶片和不同发育时期雌株叶片中，内参基因Gb18S和Gb26S的标准偏差变动大（SD>1）排除；在不同组织中，所有候选内参基因的标准偏差均小于1，可进行下一步分析。通过对相关系数排序，在所有样品中稳定性表达由高到低的内参基因分别是Gb UBQ、Gb ACT、Gb EF-1α2、Gb GAPDH、Gb EF-1α1。因此认为内参基因Gb UBQ是银杏不同组织中表达最稳定的基因，该结果和geNorm软件和NormFinder软件分析结果一致。在不同发育时期的雌株叶片和雄株叶片中，最稳定的内参基因为GbUBQ，这和对所有样品分析筛选结果相同。对不同组织分析筛选出最稳定的内参基因是GbGAPDH。