《表5 Best Keeper分析候选内参基因的表达稳定性》
*表示被排除的基因(SD>1)。
Best Keeper软件基于原始Ct值评价内参基因的稳定性。通过Best Keeper软件得到3个指标标准偏差(SD)、变异系数(CV)以及相关系数(r),SD值和CV值越小,r值越大,内参基因越稳定。表5显示,六个候选内参基因中SD值最小的是Hf TIP41(0.52),其次为Hf UBQ (0.84),最大的是Hf Hf EF-1α(1.49);CV值最小的是Hf GAPDH (1.77),其次为Hf TIP41 (2.09);r值最大的是Hf TIP41 (0.99),其次为Hf GAPDH (0.83),最小的是Hf UBQ (0.86)。SD值低于1.0被认为表达稳定。对于Hf TUB和Hf EF-1α,SD值均高于1.0,所以表达不稳定,被排除。其余四个基因根据r值大小评价内参基因的稳定性,其中r值较大的是Hf TIP41和Hf GAPDH。因此,BestKeeper软件分析出的萱草不同器官最适内参基因也是Hf TIP41和Hf GAPDH。
图表编号 | XD00229588200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.20 |
作者 | 梁锦、刘海婷、钟荣、李昊、尹冬梅、刘翔、秦巧平、张志国、段可、倪迪安 |
绘制单位 | 上海应用技术大学生态技术与工程学院、上海应用技术大学生态技术与工程学院、上海市农业科学院林木果树研究所上海设施园艺技术重点实验室、上海应用技术大学生态技术与工程学院、上海应用技术大学生态技术与工程学院、上海应用技术大学生态技术与工程学院、上海应用技术大学生态技术与工程学院、上海应用技术大学生态技术与工程学院、上海应用技术大学生态技术与工程学院、上海市农业科学院林木果树研究所上海设施园艺技术重点实验室、上海应用技术大学生态技术与工程学院 |
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