《表5 Best Keeper分析候选内参基因的表达稳定性》

《表5 Best Keeper分析候选内参基因的表达稳定性》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《萱草不同器官实时荧光定量PCR内参基因的筛选》


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*表示被排除的基因(SD>1)。

Best Keeper软件基于原始Ct值评价内参基因的稳定性。通过Best Keeper软件得到3个指标标准偏差(SD)、变异系数(CV)以及相关系数(r),SD值和CV值越小,r值越大,内参基因越稳定。表5显示,六个候选内参基因中SD值最小的是Hf TIP41(0.52),其次为Hf UBQ (0.84),最大的是Hf Hf EF-1α(1.49);CV值最小的是Hf GAPDH (1.77),其次为Hf TIP41 (2.09);r值最大的是Hf TIP41 (0.99),其次为Hf GAPDH (0.83),最小的是Hf UBQ (0.86)。SD值低于1.0被认为表达稳定。对于Hf TUB和Hf EF-1α,SD值均高于1.0,所以表达不稳定,被排除。其余四个基因根据r值大小评价内参基因的稳定性,其中r值较大的是Hf TIP41和Hf GAPDH。因此,BestKeeper软件分析出的萱草不同器官最适内参基因也是Hf TIP41和Hf GAPDH。