《表2 测序数据质控结果:青藏高原冰川棘豆适应性分子机制的转录组学初步研究》

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《青藏高原冰川棘豆适应性分子机制的转录组学初步研究》


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通过对RNA样品的质量检测,得到了冰川棘豆6个居群的17个质检合格样品,并进行转录组测序,结果如表2所示。共得到956 921 788条原始序列(Raw reads),质控后得到950 938 126条过滤后的序列(Clean reads);Q20(%)均大于98%,Q30(%)均大于95%,Q20(%)、Q30(%)分别是计算Phred数值大于20、30的碱基数占总碱基的百分比;样品的GC content(%)在40%~43%之间,GC content(%)是G、C碱基的总数量占总碱基数量的百分比。