《表3 测序结果统计:黄鳝生长差异基因发掘及其调控机制初步研究》
本实验共测6个样本,平均每个样本产出约41 000 000 Clean reads,约合6.0 Gb数据量(表3)。用Q20(单个碱基的测序错误率低于1%)和Q30(单个碱基的测序错误率低于0.1%)对这些数据的质量进行检测,Q20和Q30值分别为98.02%和94.75%以上,说明测序质量很好。将测序结果与参考基因组进行比对,匹配率在74.32%以上。将匹配到参考基因的Reads组装成基因,共得到19 149个基因。以长势差的ACG组为对照,使用RSEM计算基因与转录表达水平,分析发现差异表达基因有598个,其中有303个基因上调,295个下调。差异表达基因的火山图和统计图分别见图1-a和图1-b。
图表编号 | XD00121286900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.05 |
作者 | 霍欢欢、刘瑜、周秋白、郭枫、隗黎丽、彭墨、张燕萍、陈文静 |
绘制单位 | 江西农业大学动物科学技术学院、江西农业大学动物科学技术学院、江西农业大学动物科学技术学院、江西农业大学动物科学技术学院、江西农业大学动物科学技术学院、江西农业大学动物科学技术学院、江西省水产科学研究院、江西省水产科学研究院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |