《表4 测序数据质量:过量表达EPSPS转基因对栽培稻与杂草稻杂种后代稻瘟病抗病性的影响》
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《过量表达EPSPS转基因对栽培稻与杂草稻杂种后代稻瘟病抗病性的影响》
Raw reads表示原始序列数据的统计;Clean reads的计算方法同Raw reads,是对去除低质量数据后的测序数据进行统计;Q30:假设测序错误率为e,则QPhred=–10log10(e),代表测序的碱基质量。Q30表示碱基质量值大于30的碱基占比,比值越高,代表测序质量越好。
结合测序报告,经过分析和过滤可得到相关数据如表4,其中,WH1–获得Raw reads数为53 347 682,Clean reads数为51 660 112,碱基质量值大于30的碱基占比高于89%,表示测序结果是真实可靠的。WH1+获得Raw reads数为57 497 400,Clean reads数为55 804 468,碱基质量值大于30的碱基占比高于89%,表示测序结果良好。
图表编号 | XD00229587400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.20 |
作者 | 林凯青、韩光煜、罗琼、何平、南蓬 |
绘制单位 | 复旦大学生命科学学院生物多样性与生态工程教育部重点实验室、云南农业大学植物保护学院农业生物多样性与病害控制教育部重点实验室、云南农业大学植物保护学院农业生物多样性与病害控制教育部重点实验室、云南农业大学植物保护学院农业生物多样性与病害控制教育部重点实验室、复旦大学生命科学学院生物多样性与生态工程教育部重点实验室 |
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