《表1 测序样品质量:滇重楼根茎数字基因表达谱分析》

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《滇重楼根茎数字基因表达谱分析》


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根据测序结果质量分析可知(表1),根茎1年生龄段和3年生龄段分别获得27 892 436条、22 132 788条质量合格的原始序列,Clean read分别占Raw Reads的99.94%、99.88%。组装共得到30 185条非冗余的特异Unigene,Unigene的N50为1 109,组装完整性较高,这些Unigenes的平均长度为809.38 bp,范围集中在201~2 000 bp之间,平均GC含量分别为50.82%和50.68%。二个样本碱基读取正确率为99.9%以上(Q30)的Reads在总Reads中的占比为85%以上。由此可知,滇重楼2个样品的转录组测序质量较高,所得到的数据足以满足后续分析的要求。