《表2 样品测序产出数据质量评估情况》
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《转录组学解析茉莉酸甲酯对双孢蘑菇个体大小的影响机制》
注:CK、CT1、ET1、MJ1分别为处理后第0天空白组及第1天空白组、2%乙醇组、50μmol/L Me JA组的样品;“-”后的数字1、2、3分别表示3组平行样品,下同;Q30为原始测序量中碱基质量值大于30的碱基占总体碱基的百分比;GC为剩余基数中鸟嘌呤和胞嘧啶的数量总和占总碱基数量的百分
由表2可知,对双孢蘑菇不同处理的样本进行转录组学测序,获得的原始片段均高于48×106,对原始数据进行质量预处理后,对整个质控过程中的reads数进行统计汇总得到超过45×106的剩余片段,且有效基数均高于89%。4组样本的平均Q30值分别为91.49%、91.77%、92.29%和90.99%,平均GC相对含量分别为49.91%、49.93%、49.87%和49.87%。由此可见,转录组测序得到的数据数量和质量都较高,达到标准,可用于后续研究分析。
图表编号 | XD00209429200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.25 |
作者 | 宋媛、胡秋辉、苏安祥、裴斐、马高兴、马宁、杨文建 |
绘制单位 | 南京财经大学食品科学与工程学院江苏省现代粮食流通与安全协同创新中心江苏高校粮油质量安全控制及深加工重点实验室、南京财经大学食品科学与工程学院江苏省现代粮食流通与安全协同创新中心江苏高校粮油质量安全控制及深加工重点实验室、南京财经大学食品科学与工程学院江苏省现代粮食流通与安全协同创新中心江苏高校粮油质量安全控制及深加工重点实验室、南京财经大学食品科学与工程学院江苏省现代粮食流通与安全协同创新中心江苏高校粮油质量安全控制及深加工重点实验室、南京财经大学食品科学与工程学院江苏省现代粮食流通与安全协同创新中心江苏 |
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